此时，由黄帝带领的百姓们开始放弃茹毛饮血的生活，开始教授他们种植，于是人族变得空前壮大起来。但谁也没有想道三界灭顶的灾难快要来临了。
蚩尤在九黎族失败后便开始了一路逃亡，由于对黄帝的愤恨，使他身上的魔气越来越重。在他经过辗转逃亡数年之后，他终于找到了那件能够毁灭天地的武器—盘古斧。
盘古死后，盘古斧便遗失在了人间，没有任何生灵再见到过这把能够毁天灭地的武器，但被仇恨蒙蔽双眼的蚩尤却经过九死一生之后发现了盘古斧。
此时的蚩尤已经被仇恨冲昏了头脑，他不但痛恨炎黄二族，更加痛恨背叛了他的妖族与九黎族，于是他想要毁灭世间的一切生灵。
他将自己的肉体献祭给了盘古斧，于是久久沉睡的盘古斧苏醒了过来。没有形体的拘束后，蚩尤魂魄中因仇恨所产生的魔气瞬间便强大了起来。蚩尤的最后一点灵智被魔气吞噬干净，于是他便彻底的坠入了魔道。
这时三界的生灵谁也没有意识到，天地之间诞生了新的魔。它不再是由混沌魔气形成，而是生灵体内的仇恨而产生的魔气，它比混沌魔气要强数十倍之多。于是成魔的蚩尤终于有能力驾驭盘古斧，他挥舞着盘古斧想要毁灭天地。
天界的主宰昊天自然发现了地界的异样，但此时他却帮不了地界。他将所有的天规都刻在了掌握着天地法则的混沌钟内，而天规中严禁天界大神干预人间之事。此时的昊天已经不是天地间唯一的生灵，天地间的生灵都在疯狂的吞噬着天地灵气，这使得昊天已经没有足够的力量去驾驭混沌钟。但他并没有对人界的威胁束手旁观，他将自己的武器荡魔剑传向凡间。
荡魔剑到达人间后便被黄帝所得，但黄帝却发现人族没有人有足够的力量去使用荡魔剑，于是他带着荡魔剑却寻求妖族的帮助，希望妖王墨羽能够使用此剑。此时的妖族因蚩尤的威胁，早就与人族握手言和，但妖王墨羽也没有能力去使用此剑。
此时的蚩尤挥舞着盘古斧，已经杀戮了数以万计的三界生灵，地界生灵危在旦夕。
最后，黄帝用地界的五大神器，妖界的血殁剑，炎黄部落的伏羲琴，神农鼎，女娲石和黄帝所佩的紫龙剑的全部力量献祭给荡魔剑，并且黄帝将自己舍身献给荡魔剑为仆，荡魔剑的神力才被召唤苏醒。于是黄帝使用荡魔剑与蚩尤进行了惊天一战，最终蚩尤被打败了。
但蚩尤附身于盘古斧，荡魔剑无法毁灭盘古斧，只好将其封印在了不周山下。
于是，人间再次得到了复苏。妖族也与人族握手言和，撤回了妖界，不再为祸人间。而黄帝以龙虎山为界，将地界分为两半，分成人界与妖界。黄帝与妖王墨羽划定人界与妖界后，黄帝便用轩辕剑将两界的联系彻底斩断，只留下了唯一连接的空间。在妖界，这片空间便是荒芜之地，而在人界，这片空间则是秘境。为了驻守人妖两界的通道，黄帝在龙虎山设立了天师府，专门捕捉逃出妖界，为祸人间的妖族。
黄帝轩辕打败蚩尤之后便继续治理人间，人界一片繁荣。人们十分景仰甘愿献身的黄帝，于是将荡魔剑亦唤作轩辕剑。但十年过后，黄帝忽然带着轩辕剑消失了，只将紫龙剑留了下来。此后三界从此再无黄帝轩辕的消息。
本书首发来自，！</div>