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田尔耕、许显纯将锦衣卫内部的高级人员，基本上全部都换了个遍，有的被逮捕审查，有的被闲赋在家。
总督辽东的孙承宗，上任之后决定先将防线，撤掉了辽河防线，向朱由校请奏。理由很简单，明军此时士气低落，军容散乱，辽河防线并不能挡住后金军。朱由校随即同意了孙承宗的决定，让明军撤退到广宁，加固广宁防线。
这样的大清洗，也迅速蔓延到了军中，朱由校很快就在腾骧骑兵师、武骧骑兵师，以及京营展开了换血行动，并开始大规模的进行洗脑教育。
在孙承宗的指挥下，明军在辽西地区开始有条不紊的重振旗鼓，局势开始向有利的方向发展。
特别是军中，大批思想觉悟高的普通士兵被提拔了上来，构成了基层军官体系，军事素质方面自然是有待提高，但是原本那批基层军官，也未必高明多少。
锦衣卫和东厂的糜烂，就是因为高级人员产生了自己的思想，才会欺下罔上，蒙骗皇帝。基层人员的思想相对单纯，而且容易洗脑。同时也因为他们得到提拔，忠诚性要比原先的人员要高得多。
辽东富庶，然而到处都是荒地，蒙古人在明军后方城池郊外牧马，这简直无法容忍。满桂接到命令后，带领着五千明军，迅速扫荡了周围的蒙古部落，非常轻松的就击败了这些结构松散的蒙古小部落，然后又招募蒙古人，安排他们生产放牧。
天启元年，初夏。
随着查抄资产的公开，一群东林党哑口无言。
大清洗过后就是大换血，空出的职位，首先进行了结构上的优化。空缺人员，一律从基层提拔上来，然后进行系统的思想灌输。
气温开始彻底回暖，朱由校却已经不再上朝，不过还在批阅内阁送来的奏折。属于东林党温和派的叶向高，处理政务上还算比较稳妥的。
改革还在持续，最大的变化就是朱由校提高了锦衣卫和东厂的人员待遇，俸禄提高了一大截。
当务之急还是要把京营训练出来。
随后孙承宗按照君臣二人商定的策略，开始将前线百姓全部转移到后方，安排这些辽西百姓和辽东逃过来的百姓开垦土地。但凡容易被后金军劫掠的地区，百姓一律转移到山海关外、宁远、锦州一线。
孙承宗已经陆续发来了几道奏折，向朱由校汇报了一番辽东局势。辽东地区基本上已经全部陷落，如今明军退守广宁，并在广宁以东的辽河西岸构筑了第一条防线，中间又构筑了一条防线，广宁则形成第三道防线。
骆思恭当了这么多年的锦衣卫指挥使，这种扯虎皮的职务，最是合适搜刮钱财了。
对于朱由校来说，他又宰了一头肥猪。
只是军中的清洗要温和很多，毕竟军队的思想问题还不是那么严重。因此只是将一些不合适的军官打发去搞军屯。
“皇上，军工厂那边上报说，工匠们已经研发出了十几种燧发枪，皇上您是不是过去看看？”杨光对朱由校禀报道。
同时整顿兵马、加固防线、囤积军粮、守城物资，并展开军屯，加强明军自给自足的能力。
话说骆思恭奉命带着锦衣卫到辽东彻查，骆思恭在辽东转了一圈，可谓收获颇丰，被他抓到小辫子的官员、武将纷纷向他行贿。骆思恭吃得肚皮滚圆，象征性的抓了几个小喽啰，然后带着人回京城向皇帝复命去了。
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京营基本上是一支没有作战经验的军队，不论怎么清洗，都不会造成战斗力下降，因为本来就很烂。