在雅加达城港口，李丽华宣布了中华王府内务部拟定的《爪哇岛善后章程》，大部分是尹峰和徐宏基讨论后的决定。
按照章程规定：在叛乱期间帮助华人作战的爪哇各个领主、太守、苏丹，都可以保留自己的土地不变。而参与了与华人作战的那些领主、太守、苏丹，统统被剥夺对自己领土的权利，其家族所有人员一律流放到东边的香料群岛。他们的土地现在归中华王所有，经过丈量后，将在明年年初开始大拍卖。有权优先参加拍卖的是：中华联合公司、各家华人公司、内地商家，最后才是成为中华军盟友的那些土著领主、苏丹。
这善后章程后来经过修改，在与暹罗的战争结束后，于整个南洋颁布执行。所有参与叛乱的马来人贵族阶层在战后都遭到清洗，被大批流放到了香料群岛，最远的被放逐到了关岛。爪哇的马达兰苏丹国王族后裔得到特别照顾，被流放到了种子岛去种地。他们大多在其后几年的冬天里，陆续冻死在岛上。
这些贵族领主留下的土地使得中华军控制下的土地增加了一倍，移民村庄、屯田农庄、种植园等等到处都需要人去耕作。
尹峰在书房召开内务部会议时，告诉徐宏基：“移民比占土地更加重要！把移民南洋的条件改一下：只要愿意去南洋的，每个家庭按成人人头算，每人送100亩地，连续耕种五年并缴租后，就可以归自己家所有。还有，再加一条，上面提的100亩是开垦过的熟地，移民自己开垦的荒地，只要连续耕作三年，三年内免税。再加上这一条，参加中华军满三年的可以获得南洋任何地方的200亩地，连续五年耕作期间免租金。”
徐宏基一边快速记录尹峰的讲话，一边笑着说：“100亩，呵呵，200亩，这么说得话，连我都想去南洋占几块地了。”
刚从马尼拉回来的曾山立刻抢白：“你这牛鼻子，你家在吕宋的地还少吗？连你还没出世的儿子，你都给他备好结婚的宅子了吧？”
徐宏基涨红了脸反击道：“你们曾家人多，要是去南洋抢地，整个巴厘岛都给你们家都不够”
“这就不对了，巴厘岛上可是我们的盟友，不能抢他们土地吧？”
徐宏基流荡多年，最近才能算安定下来。这不，饱暖思yin欲，这前游方道士经不住诱惑，刚刚在四十岁年纪娶了老婆，马上要有孩子了。
尹峰笑着打住两人的话头，道：“说到吕宋，干希腊人承认我们对吕宋的占有，也愿意出黄金赎回战俘。不过，干希腊人始终是狡诈之徒，曾山，以后绝不能轻易放松对干希腊人的警惕。他们的大帆船前来马尼拉时，必须在马尼拉湾口的战争岛接受上船检查，记住，这一条要列在和平协议内。”
曾山连连点头称是。如今，已经没有人能当面质疑尹峰的决定了。这对尹峰来说，并非是好事情，只是他自己还没觉察。
他拿出一份由梅新兰誊写过的文件，递给徐宏基：“现在几位内务部书记官都在，那就请大家看看这个：新的中央官制条例，然后提提意见。”
徐宏基等人立刻严肃起来。徐宏基坐直身子拿过文件，其余几人实在忍耐不主，纷纷凑上前去观看。
这是关系到在座所有人的文件，也是尹峰正式建立完整的国家体制的开始。
新的中央官制：首为内阁，以下依次为外务部、吏部、民政部、度支部、礼部、学部、兵部、法部、农工商部、邮传部、理藩部；与内阁平行的机构为大议事会、审计院、督察院、大理院、军资府，共十一部三院一府一会。
尹峰的这种官制设计，参考了另一时空清朝未年的官制改革。这样一来可以避免明朝官制的叠床架屋、权力部门互相掣肘情况，各部门都具有其专门职能，分工更加明确。如学部、兵部、法部、农工商部、邮传部等一些机构的设立，也大大扩大了国家的社会管理职能，尤其是经济文化的职能，改变了传统中国的官府只管收税的局面，政府开始关注国计民生等更广阔的范围。